Rendue en Egypte, l'aventurière Lara Croft se retrouve mêlée à une guerre ancestrale qui voit le dieu Seth étendre son pouvoir maléfique sur le pays. Aidée par son rival Carter, Lara va bénéficier également de la présence de deux divinités, Isis et Horus. Le but de la mission sera de retrouver les fragments du dieu Osiris disséminés à travers l'Egypte par Seth, ce dernier ayant ainsi priver Osiris de la vie éternelle...